(РЕШЕНО) Потерял покой. Вместе с библиотекой libicui18n.so.56

yaa	# 8 лет назад (отредактировано 8 лет назад)
Темы: 23 Сообщения: 170 Участник с: 30 декабря 2011	Здрассте всем. У меня в R не идёт в установка нужного пакета: `Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) : unable to load shared object '/home/varnava/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/stringi/libs/stringi.so': libicuuc.so.56: cannot open shared object file: No such file or directory ERROR: lazy loading failed for package ‘stringr’` Но файлики с названием, напоминающим припев из фильма Кин-Дза-Дза, вроде у меня есть: `>> pacman -Qsq icu harfbuzz-icu icu lib32-icu python-pyicu` Тока там цифирки немного не те: `>> ls -l /usr/lib \| grep icui18n lrwxrwxrwx 1 root root 18 Apr 2 20:18 libicui18n.so -> libicui18n.so.57.1 lrwxrwxrwx 1 root root 18 Apr 2 20:18 libicui18n.so.57 -> libicui18n.so.57.1 -rwxr-xr-x 1 root root 2591776 Apr 2 20:18 libicui18n.so.57.1` "Я же с ней и так и эдак" (С): `( /usr/lib ) >> sudo ln -s libicui18n.so.57.1 libicui18n.so.56.1 ( /usr/lib ) >> sudo ln -s libicui18n.so.57.1 libicui18n.so.56` Эффект предсказуемы. Вернее полное его отсутствие.

# 8 лет назад (отредактировано 8 лет назад)

Сообщения: 170

Участник с: 30 декабря 2011

Здрассте всем.

У меня в R не идёт в установка нужного пакета:

Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) :
  unable to load shared object '/home/varnava/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/stringi/libs/stringi.so':
  libicuuc.so.56: cannot open shared object file: No such file or directory
ERROR: lazy loading failed for package ‘stringr’

Но файлики с названием, напоминающим припев из фильма Кин-Дза-Дза, вроде у меня есть:

>> pacman -Qsq icu
harfbuzz-icu
icu
lib32-icu
python-pyicu

Тока там цифирки немного не те:

>> ls -l /usr/lib | grep icui18n
lrwxrwxrwx  1 root root       18 Apr  2 20:18 libicui18n.so -> libicui18n.so.57.1
lrwxrwxrwx  1 root root       18 Apr  2 20:18 libicui18n.so.57 -> libicui18n.so.57.1
-rwxr-xr-x  1 root root  2591776 Apr  2 20:18 libicui18n.so.57.1

"Я же с ней и так и эдак" (С):

( /usr/lib )  >> sudo ln -s libicui18n.so.57.1 libicui18n.so.56.1
( /usr/lib )  >> sudo ln -s libicui18n.so.57.1 libicui18n.so.56

Эффект предсказуемы. Вернее полное его отсутствие.

ka	# 8 лет назад
Темы: 0 Сообщения: 63 Участник с: 19 марта 2016	А что говорит ldd /полный путь до бинарника кому нужна либа?

warlock9000	# 8 лет назад
Темы: 6 Сообщения: 766 Участник с: 21 марта 2016	Оно работало, а потом поломалось или сразу так? https://github.com/warlock90000/awesome

Medar	# 8 лет назад
Темы: 12 Сообщения: 402 Участник с: 08 февраля 2013	А firefox не сломался?

yaa	# 8 лет назад
Темы: 23 Сообщения: 170 Участник с: 30 декабря 2011	ka А что говорит ldd /полный путь до бинарника кому нужна либа? Ничего не говорит. У R свой механизма установки пакетов. warlock9000 Оно работало, а потом поломалось или сразу так? Не могу точно сказать, но когда-то оно работало. Medar А firefox не сломался? Вроде норм. Обратил внимание в логах установки, что ругается уже на другую библиотеку, видать подмена версий всё-таки сработала. Вот полный лог Rstudio (оболочка над R): > install.packages("stringr") Installing package into ‘/home/varnava/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2’ (as ‘lib’ is unspecified) --2016-04-14 09:52:00-- https://cran.rstudio.com/src/contrib/stringr_1.0.0.tar.gz Resolving cran.rstudio.com (cran.rstudio.com)... 54.192.92.128 Connecting to cran.rstudio.com (cran.rstudio.com)\|54.192.92.128\|:443... connected. HTTP request sent, awaiting response... 200 OK Length: 34880 (34K) [application/x-gzip] Saving to: ‘/tmp/RtmpJOihJe/downloaded_packages/stringr_1.0.0.tar.gz’ 0K .......... .......... .......... .... 100% 147K=0.2s 2016-04-14 09:52:01 (147 KB/s) - ‘/tmp/RtmpJOihJe/downloaded_packages/stringr_1.0.0.tar.gz’ saved [34880/34880] File /home/varnava/.Renviron contains invalid line(s) DvpZNW2Io9v8ovxEs1lQ5TMB4 MwbrtKM39P5IhyacfmcNIlBqlie3mgARerng0w1bb2oGglGaIy 438173296-aDdE0zviQH6tHAuWOGnVGQQAKvIVTLKRwpDTIsos 8MTes9Qa6FFhfih1dRFhZkQYN2Xr40t3Y4tAAAFOnDsT0 They were ignored * installing source package ‘stringr’ ... package ‘stringr’ successfully unpacked and MD5 sums checked R inst preparing package for lazy loading Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) : unable to load shared object '/home/varnava/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/stringi/libs/stringi.so': libicuuc.so.56: cannot open shared object file: No such file or directory ERROR: lazy loading failed for package ‘stringr’ * removing ‘/home/varnava/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/stringr’ Warning in install.packages : installation of package ‘stringr’ had non-zero exit status The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpJOihJe/downloaded_packages’

yaa

# 8 лет назад

Темы: 23

Сообщения: 170

Участник с: 30 декабря 2011

ka
А что говорит ldd /полный путь до бинарника кому нужна либа?

Ничего не говорит. У R свой механизма установки пакетов.

warlock9000
Оно работало, а потом поломалось или сразу так?

Не могу точно сказать, но когда-то оно работало.

Medar
А firefox не сломался?

Вроде норм.

Обратил внимание в логах установки, что ругается уже на другую библиотеку, видать подмена версий всё-таки сработала. Вот полный лог Rstudio (оболочка над R):

> install.packages("stringr")
Installing package into ‘/home/varnava/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2’
(as ‘lib’ is unspecified)
--2016-04-14 09:52:00--  https://cran.rstudio.com/src/contrib/stringr_1.0.0.tar.gz
Resolving cran.rstudio.com (cran.rstudio.com)... 54.192.92.128
Connecting to cran.rstudio.com (cran.rstudio.com)|54.192.92.128|:443... connected.
HTTP request sent, awaiting response... 200 OK
Length: 34880 (34K) [application/x-gzip]
Saving to: ‘/tmp/RtmpJOihJe/downloaded_packages/stringr_1.0.0.tar.gz’

     0K .......... .......... .......... ....                 100%  147K=0.2s

2016-04-14 09:52:01 (147 KB/s) - ‘/tmp/RtmpJOihJe/downloaded_packages/stringr_1.0.0.tar.gz’ saved [34880/34880]
   File /home/varnava/.Renviron contains invalid line(s)
      DvpZNW2Io9v8ovxEs1lQ5TMB4
      MwbrtKM39P5IhyacfmcNIlBqlie3mgARerng0w1bb2oGglGaIy
      438173296-aDdE0zviQH6tHAuWOGnVGQQAKvIVTLKRwpDTIsos
      8MTes9Qa6FFhfih1dRFhZkQYN2Xr40t3Y4tAAAFOnDsT0
   They were ignored

* installing *source* package ‘stringr’ ...
** package ‘stringr’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** R
** inst
** preparing package for lazy loading
Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) :
  unable to load shared object '/home/varnava/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/stringi/libs/stringi.so':
  libicuuc.so.56: cannot open shared object file: No such file or directory
ERROR: lazy loading failed for package ‘stringr’
* removing ‘/home/varnava/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/stringr’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘stringr’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
	‘/tmp/RtmpJOihJe/downloaded_packages’

vasek	# 8 лет назад (отредактировано 8 лет назад)
Темы: 47 Сообщения: 11743 Участник с: 17 февраля 2013	В подробности не вдавался, так как даже не знаю что такое ...R.... , но принцип везде один ... yaa libicuuc.so.56: cannot open shared object file: No such file or directory Компьютер не ошибается, тут одно из двух - или файла нет действительно или если имеется, то не находится по указанным путям... Решил проверить у себя …...... $ ldconfig -p \| grep libicuuc …. (ищем ее в кэше....) libicuuc.so.57 (libc6) => /usr/lib/libicuuc.so.57 ... (имеется, но обрати внимание на версию) libicuuc.so (libc6) => /usr/lib/libicuuc.so $ pacman -Qo /usr/lib/libicuuc.so.57 … (смотрим какому пакету принадлежит) /usr/lib/libicuuc.so.57 принадлежит icu 57.1-1 … (а у тебя какая версия ..?) ...... может нужно обновится...? Так что пока реши проблему с библиотекой …... не забывая, что у тебя x86_64 .... Ошибки не исчезают с опытом - они просто умнеют

vasek

# 8 лет назад (отредактировано 8 лет назад)

Темы: 47

Сообщения: 11743

Участник с: 17 февраля 2013

В подробности не вдавался, так как даже не знаю что такое ...R.... , но принцип везде один ...

yaa
libicuuc.so.56: cannot open shared object file: No such file or directory

Компьютер не ошибается, тут одно из двух - или файла нет действительно или если имеется, то не находится по указанным путям...
Решил проверить у себя …......
$ ldconfig -p | grep libicuuc …. (ищем ее в кэше....)
libicuuc.so.57 (libc6) => /usr/lib/libicuuc.so.57 ... (имеется, но обрати внимание на версию)
libicuuc.so (libc6) => /usr/lib/libicuuc.so
$ pacman -Qo /usr/lib/libicuuc.so.57 … (смотрим какому пакету принадлежит)
/usr/lib/libicuuc.so.57 принадлежит icu 57.1-1 … (а у тебя какая версия ..?) ...... может нужно обновится...?
Так что пока реши проблему с библиотекой …... не забывая, что у тебя x86_64 ....

Ошибки не исчезают с опытом - они просто умнеют

yaa	# 8 лет назад
Темы: 23 Сообщения: 170 Участник с: 30 декабря 2011	vasek $ ldconfig -p \| grep libicuuc …. (ищем ее в кэше....) libicuuc.so.57 (libc6) => /usr/lib/libicuuc.so.57 ... (имеется, но обрати внимание на версию) libicuuc.so (libc6) => /usr/lib/libicuuc.so $ pacman -Qo /usr/lib/libicuuc.so.57 … (смотрим какому пакету принадлежит) /usr/lib/libicuuc.so.57 принадлежит icu 57.1-1 … (а у тебя какая версия ..?) ...... может нужно обновится...? Так что пока реши проблему с библиотекой …... не забывая, что у тебя x86_64 .... `>> ldconfig -p \| grep libicuuc libicuuc.so.57 (libc6,x86-64) => /usr/lib/libicuuc.so.57 libicuuc.so.57 (libc6) => /usr/lib32/libicuuc.so.57 libicuuc.so (libc6,x86-64) => /usr/lib/libicuuc.so libicuuc.so (libc6) => /usr/lib32/libicuuc.so` `>> pacman -Qo /usr/lib/libicuuc.so.57 /usr/lib/libicuuc.so.57 is owned by icu 57.1-1` Да, конфликт версий. Даунгрейд не хочется делать.

yaa

# 8 лет назад

Темы: 23

Сообщения: 170

Участник с: 30 декабря 2011

vasek
$ ldconfig -p | grep libicuuc …. (ищем ее в кэше....)
libicuuc.so.57 (libc6) => /usr/lib/libicuuc.so.57 ... (имеется, но обрати внимание на версию)
libicuuc.so (libc6) => /usr/lib/libicuuc.so
$ pacman -Qo /usr/lib/libicuuc.so.57 … (смотрим какому пакету принадлежит)
/usr/lib/libicuuc.so.57 принадлежит icu 57.1-1 … (а у тебя какая версия ..?) ...... может нужно обновится...?
Так что пока реши проблему с библиотекой …... не забывая, что у тебя x86_64 ....

 >> ldconfig -p | grep libicuuc
	libicuuc.so.57 (libc6,x86-64) => /usr/lib/libicuuc.so.57
	libicuuc.so.57 (libc6) => /usr/lib32/libicuuc.so.57
	libicuuc.so (libc6,x86-64) => /usr/lib/libicuuc.so
	libicuuc.so (libc6) => /usr/lib32/libicuuc.so

>> pacman -Qo /usr/lib/libicuuc.so.57
/usr/lib/libicuuc.so.57 is owned by icu 57.1-1

Да, конфликт версий. Даунгрейд не хочется делать.

yaa	# 8 лет назад (отредактировано 8 лет назад)
Темы: 23 Сообщения: 170 Участник с: 30 декабря 2011	Спасибо, браты. Вопрос снят установкой альтернативной гитхабовской версии пакета (devtools::install_github("hadley/stringr"))