В pacman 3.0.5-1 есть проблема с правами на файлы при установке пакетов с символьными ссылками. На некоторые файлы могут быть выставлены права 0777. Это исправлено в версии 3.0.5-2.

Подробности:
http://bugs.archlinux.org/task/7461
http://archlinux.org/pipermail/pacman-dev/2007-June/008579.html

Permissions issue with pacman 3.0.5-1