А я вот взял, да проверил на другом дистрибутиве. На кубунту. Здесь проблемы нет. Прошло уже 36 часов аптайма. Таймстампы проверяются, судя по этому:
$ cat /proc/sys/net/ipv4/tcp_timestamps
1
Так что получается, проблема все-таки в арче?

Upd. Нет, это все таки случилось. Через 38 часов...